METI备案认证流程主要包括以下几个步骤：

1. 准备材料：根据要求，需要准备包括产品的PSE证书及报告、英文或日文的说明书、规格书、保证申明、申请表、产品图片以及日本进口商营业执照等资料。

2. 递交测试报告与相关文件：将上述准备好的文件递交至日本经济产业省。

3. 申请文件注册：在递交文件后，需要进行文件的注册。

4. 产品设计及确认：完成文件注册后，需要设计产品并进行确认。

影响METI备案认证审核的因素包括：

1. 法规和标准理解：由于日本对于进口产品的法规和标准要求较为严格，申请人需要充分了解并遵守这些规定。语言和文化的差异，以及法规的不断更新和变化，理解这些规定可能会成为一大挑战。

2. 文件准备和提交：METI备案需要提交一系列的文件，这些文件需要真实、准确、完整，并且符合日本的相关规定。准备这些文件需要耗费大量的时间和精力，而且一旦文件不符合要求，还可能导致申请被拒绝。

3. 审核周期长：METI备案的审核周期通常较长，可能需要数周甚至数月的时间。这对于急需进入日本市场的企业来说，可能会带来一定的困扰和不确定性。

4. 产品符合性评估：申请人需要证明其产品符合日本的相关法规和标准。这可能需要进行一系列的测试和评估，以确保产品的安全性、环保性、性能等方面符合要求。这些测试和评估可能会增加企业的成本和时间负担。

综上所述，METI备案认证流程是一个涉及多个步骤和要求的复杂过程，而影响审核的因素包括对法规和标准的理解、文件的准备和提交、审核周期的长度以及产品符合性评估等。