在潍坊进行ISO9001认证过程中，如果遇到问题，可以采取以下措施来应对和解决：

首先，需要明确遇到的问题类型，可能包括但不限于：

1. 复杂性和文档编制问题：ISO9001认证需要制定一系列的文件和程序，可能涉及复杂的流程和术语。

2. 组织文化变革问题：实施ISO9001可能需要对组织的文化和工作方式进行调整。

3. 资源投入问题：实施ISO9001需要投入时间、人力和财务资源。

4. 内部审核和改进问题：内部审核需要时间和精力，同时发现的问题可能需要额外的改进工作。

5. 员工培训和意识问题：ISO9001要求员工了解质量管理体系和要求，需要进行培训和宣传。

6. 认证机构选择问题：选择合适的认证机构可能是一个挑战，需要考虑多个因素。

针对上述问题，可以采取以下针对性应对措施：

A. 复杂性和文档编制问题：

1. 明确分工，指定责任人负责文件编制。

2. 采用简洁明了的语言，避免使用过于复杂的术语。

3. 寻求咨询公司的帮助，以理清头绪、加快进度。

B. 组织文化变革问题：

1. 明确传达认证的目标和益处，鼓励员工参与和合作。

2. 通过培训和教育，提高员工对ISO9001标准的认识和接受度。

3. 设立奖励机制，激励员工积极参与质量改进活动。

C. 资源投入问题：

1. 合理规划时间表，明确资源分配。

2. 确保组织可以承担认证过程中的工作负担，必要时寻求外部资金支持。

3. 优化内部流程，提高工作效率，减少不必要的资源浪费。

D. 内部审核和改进问题：

1. 建立有效的内部审核团队，制定清晰的内部审核计划。

2. 对审核中发现的问题进行及时整改，并跟踪验证整改效果。

3. 鼓励员工提出改进建议，持续改进质量管理体系。

E. 员工培训和意识问题：

1. 制定培训计划，提供针对性的培训内容。

2. 加强员工对ISO9001标准的理解和执行能力。

3. 通过定期考核和评估，确保员工达到标准要求。

F. 认证机构选择问题：

1. 与多家认证机构进行沟通，了解其经验和能力。

2. 选择信誉良好、服务优质的认证机构进行合作。

3. 避免选择价格过低或服务质量差的认证机构。

在认证过程中，加强与认证机构的沟通和协作也是非常重要的。这包括：

1. 及时沟通：与认证机构保持密切联系，及时沟通认证进展和遇到的问题。

2. 积极配合：按照认证机构的要求提供必要的文件和资料，积极配合现场审核工作。

3. 反馈意见：对认证机构提出的意见和建议进行认真分析和整改，不断提高质量管理体系的有效性。

如果初次认证未通过审核，可以采取以下措施进行改进并重新申请：

1. 分析原因：与认证机构的审核员进行沟通，详细了解审核中发现的问题和不足之处。

2. 制定整改计划：针对不符合项制定具体、可操作的整改计划，并明确责任人和时间节点。

3. 加强培训：对员工进行再次培训，提高员工对ISO9001标准的理解和执行能力。

4. 完善体系：对质量管理体系进行全面审查和完善，确保体系符合ISO9001标准的要求。

5. 重新申请：在完成整改并经过内部评估认为符合要求后，向认证机构提出重新审核的申请。

综上所述，潍坊ISO9001认证过程中遇到问题并不可怕，关键在于采取正确的应对措施和加强沟通与协作。通过持续改进和不断努力，企业一定能够顺利通过ISO9001认证并不断提升质量管理水平。