运城BCI良好棉花认证的原则主要包括以下几点：

1. 关心和保护纤维品质：确保棉花的质量符合标准。

2. 提倡体面劳动：确保棉农享有公平的劳动报酬、良好的工作条件、健康与安全保障。

3. 将对作物保护措施有害的影响降至低：减少农药和化肥的使用，采用生物防治等自然方法控制病虫害。

4. 保护自然栖息地：减少对森林的破坏，保护野生动植物的栖息地和生态系统。

5. 高效用水与保护水资源：推广节水灌溉技术，确保水资源的合理利用，减少污染和浪费。

6. 重视土壤健康：通过轮作、覆盖作物等措施保持土壤肥力，减少土壤侵蚀，促进土壤生物多样性。

在BCI良好棉花认证过程中，如果遇到问题，可以采取以下措施：

1. 与BCI沟通：如果对认证流程或标准有疑问，可以直接与BCI联系，获取官方的指导和帮助。

2. 参与培训和指导：BCI为会员组织提供相关培训和指导，帮助他们理解和落实BCI标准。

3. 制定个性化的可持续发展计划：与BCI合作制定个性化的可持续发展计划，明确改进目标、措施和时间表。

4. 监测与认证：BCI及其合作伙伴定期对棉农的实施情况进行监测，收集数据以评估其进展和成效。

5. 建立技术支持网络：确保棉农在实施过程中遇到问题时能够得到及时帮助。

通过这些措施，可以有效地解决认证过程中遇到的问题，确保棉花生产符合BCI的良好棉花标准。