在泰国ISO14001认证过程中，如果发现问题，应按照以下步骤进行处理：

识别问题：首先，需要明确识别出在审核过程中发现的具体问题点，这些问题可能涉及环境因素的控制、法律法规的遵守、环境目标的设定等多个方面。

整改意见：审核员会针对发现的问题提出整改意见，企业需要根据这些意见进行具体的整改措施。

制定纠正措施：企业需要针对发现的问题制定并实施纠正措施，这可能包括修改管理文件、改进操作流程、加强员工培训等。

实施整改：根据审核员的反馈和企业自身制定的纠正措施，进行实际的整改工作，确保问题得到解决。

重新提交资料：整改完成后，企业需要重新提交相关的资料和文件，以便认证机构进行复审。

复审：认证机构将对企业的整改情况进行复审，可能包括文件审查和现场审核，以确保问题已经得到妥善解决。

持续改进：即使在获得ISO14001认证后，企业也需要持续关注环境保护和可持续发展的新动态，不断改进自身的环境管理体系。

定期复审和维护：企业需要定期进行内部审核和管理评审，以确保其环境管理体系的持续有效性和符合性。

通过这些步骤，企业可以确保在ISO14001认证过程中发现的问题得到有效处理，并持续提升其环境管理水平。