ISCC认证审核的基本流程通常包括以下几个步骤：

选择合适的认证体系和认证机构：企业需要根据自身产品类型和市场目标确定是否需要ISCC认证，并选择合适的认证体系（如ISCC PLUS、ISCC EU等），然后选择一家具备ISCC资质的认证机构（CB），并与其签订认证服务合同。

注册：在ISCC网站上下载新的ISCC注册表并填写完整，然后发送到ISCC指定的邮箱进行注册，邮箱地址为：registration@iscc-system.org。

准备审核材料：根据ISCC要求准备审核材料，并组织内部人员进行内部审核，完成内部审核报告。准备的材料包括但不限于管理文件、物料平衡记录台账、温室气体计算表等。

外部审核：认证机构对企业进行外部审核并提出审核意见，企业必须在规定时间内根据审核意见完成整改。

整改：整改完成后，认证机构完成审核报告，并签发ISCC证书。

证书信息公布：认证机构提交所有关于证书的必要信息给ISCC，ISCC在网站上公布证书信息。

ISCC认证的申请难度取决于多个因素，包括企业是否满足ISCC认证的基本条件、是否能够提供完整的审核材料、以及是否能够顺利通过现场审核等。以下是一些影响申请难度的因素：

资质要求：企业必须具备从事收集、加工、贸易回收废弃物和残渣或其产品的相关资质。

管理体系文件：需要准备ISCC管理体系文件，包括认证所覆盖的程序文件、组织架构、人员职责、风险评估等。

培训和内审：需要有培训计划、记录、培训资料及培训结果评估；内审过程记录、内审报告和管理评审。

过程可追溯性：涉及的采购、生产、销售等过程的相关文件，如合同、发票、生产记录等，需要确保过程可追溯。

物料平衡：企业生产、销售过程中的相关报表，确保物料平衡的准确性和真实性。

温室气体排放监测：对于有温室气体（GHG）减排计算要求的企业，则需要准备GHG计算相关的资料。

总的来说，ISCC认证的申请难度取决于企业对ISCC要求的理解和准备程度。如果企业能够严格按照ISCC的要求进行准备和整改，并通过认证机构的审核，那么ISCC认证的申请难度是可以被管理的。