当ISO9001认证审核发现不合格时，企业应采取以下措施进行应对和改进：

分析原因：与认证机构的审核员进行沟通，详细了解审核中发现的问题和不足之处，确保对不合格项有清晰的认识。

制定整改计划：针对审核中发现的不符合项，制定具体、可操作的整改计划。整改计划应明确责任人和时间节点，确保整改措施得到有效执行。

加强内部培训：对员工进行ISO9001标准和要求的培训，提高员工对标准的理解和执行能力。通过培训，确保员工能够按照标准要求进行工作，减少不合格项的产生。

完善质量管理体系：根据审核中发现的问题，对质量管理体系进行全面审查和完善。确保体系符合ISO9001标准的要求，并能够持续有效运行。

执行纠正措施：按照整改计划认真落实纠正措施，确保问题得到有效解决。同时，对纠正措施的执行情况进行跟踪和验证，确保整改效果达到预期。

重新申请审核：在完成整改并经过内部评估认为符合要求后，向认证机构提出重新审核的申请。在重新申请时，应严格遵守审核流程，确保再次审核的顺利通过。

质量管理体系：

审查工厂是否建立了完善的质量管理体系，能否持续稳定地生产出符合质量要求的产品。

对从原材料采购到成品出厂的每一个环节进行检查，确保产品质量的可控性和可追溯性。

供应链与供应商管理：

对供应链的可追溯性、供应商评估和选择过程进行检查，以确保供应链的可靠性和合规性。

劳动权益与员工福利：

检查工厂是否尊重和保护员工的劳动权益，如合理工资、合法工时、劳动合同、福利待遇等。

评估工厂的工作条件、健康与安全保护措施以及应急准备情况。

环境保护与可持续性：

评估工厂的环境保护措施，包括废物处理、能源使用、减少污染等，以确保生产过程符合环保法规。

法律法规与合规性：

核实工厂是否遵守当地、国家和国际上的相关法律法规，如劳动法、环境法等。

社会责任与商业道德：

评估工厂是否履行社会责任，包括对当地社区的影响以及商业道德等方面。

检查工厂是否从事任何不道德或不合法的商业活动，并建立反腐败和反贿赂机制。

文件与记录管理：

审查工厂的文件和记录管理情况，确保所有文件都是真实、完整和有效的。

检查工厂是否建立了质量管理体系文件，并对其进行有效管理和维护。

现场管理与生产环境：

审查工厂的现场管理情况，确保各个区域整洁有序，符合TJX的审核标准。

检查生产设备、机器和工具的安全性和可靠性，并对其进行定期维护。