METI备案认证的难点主要体现在以下几个方面：

法规和标准理解：日本对于进口产品的法规和标准要求较为严格，申请人需要充分了解并遵守这些规定。由于语言和文化的差异，理解这些规定可能会成为一大挑战。

文件准备和提交：METI备案需要提交一系列的文件，包括产品说明书、技术规格书、测试报告等。这些文件需要真实、准确、完整，并且符合日本的相关规定。准备这些文件需要耗费大量的时间和精力，一旦文件不符合要求，还可能导致申请被拒绝。

审核周期长：METI备案的审核周期通常较长，可能需要数周甚至数月的时间。这对于急需进入日本市场的企业来说，可能会带来一定的困扰和不确定性。不过，一般情况下，METI备案的处理周期为5~7个工作日，快可加急至3个工作日。

产品符合性评估：申请人需要证明其产品符合日本的相关法规和标准，这可能需要进行一系列的测试和评估。这些测试和评估可能会增加企业的成本和时间负担。

实地审核要求：审核人员可能会实地考察生产设施，确保其符合日本的技术法规和标准要求，包括生产线布局、设备状态、操作规范等。检查生产过程中的工艺流程是否规范，是否符合安全、环保等要求，以及是否存在潜在的质量或安全隐患。核实企业在现场提供的文件资料是否完整、准确，包括产品规格书、测试报告、认证证书等，以证明产品符合相关标准和法规。

METI备案认证审核要点包括：

PSE证书和测试报告：需要提供有效的PSE证书和测试报告，确保其符合日本电气和原料安全法的要求。

产品相关文件：提供产品的说明书、规格书、产品照片以及符合PSE标志的标签图片。

自主检查记录：提供自主检查记录，以证明产品符合相关安全标准。

进口商信息：提供日本进口商的营业执照、联系人信息及联系方式。

申请者资质：申请者必须是在日本注册登记的企业或法人，具有独立的法人资格和合法的经营资格。

产品铭牌：产品铭牌上必须标有采购商名称或ID，以便在产品销售过程中进行监督管理。

技术评估和检测：确保产品符合日本相关法规和标准，可能需要进行一系列的测试和评估。