工厂要配合FSC森林认证，可以按照以下步骤进行：

联系认证机构：工厂需要联系一家或多家FSC认可的认证机构，并提供必要的基本信息，以便认证机构对所需的认证成本和时间做出初步的估算。

选定认证机构：选定合适的认证机构，并与其签署认证协议。

准备审核材料：工厂需要按照认证机构的要求，准备相关文件和资料，包括但不限于工厂的生产流程、原材料来源、质量控制等方面的信息。

配合现场审核：在认证机构的安排下，工厂需要配合进行现场审核，审核员会评估工厂是否符合FSC森林认证的标准和要求。

整改与改进：如果审核中发现不符合项，工厂需要按照认证机构的要求进行整改和改进，并重新接受审核。

关于临沂FSC森林认证的审核时间，一般来说，审核周期的长短取决于多个因素，包括工厂的规模、生产工艺的复杂性、认证机构的工作效率等。在企业自身配合良好的情况下，单现场一般在5到20天左右可以完成FSC认证所需要的文件及其他工作。同时，证书办理大约需要30个工作日左右，但具体时间可能会因企业实际情况和认证机构的工作效率而有所不同。因此，工厂在申请FSC森林认证时，应提前了解并规划好时间，以确保认证过程的顺利进行。

另外，FSC森林认证的有效期一般为5年，但每年都需要进行年审，以确保工厂持续符合认证标准。如果逾期不年审或换证，证书将会被暂停，面临过期和失效无法使用的情况。因此，工厂需要重视年审工作，并积极配合认证机构进行年审。