以下是对如何有效进行C-TPAT认证内部审核以及哪些机构可以开展C-TPAT认证审核的详细解答：

1. 制定评审计划：

2. 根据C-TPAT的要求和目标，制定详细的评审计划，包括时间、地点、人员、设备等。

3. 准备相关文件和资料：

4. 整理和完善与C-TPAT认证相关的文件和资料，如公司基本信息、法律文件、生产设施信息、管理体系文件、人员文件、安全管理文件、物流安全资料、合同文件、问题调查记录、相关证书和许可证等。

5. 进行内部评审与改进：

6. 进行内部评审，识别现有管理体系的差距和不足，制定改进计划。这包括评估安全措施和程序的合规性，以及识别可能存在的风险和漏洞。

7. 建立持续改进的机制，定期对安全管理系统进行评估和更新，以不断提升供应链的安全性。

8. 员工培训和意识提升：

9. 对员工进行C-TPAT标准和要求的培训，提高员工的安全意识和操作技能。确保员工了解并遵守C-TPAT的相关规定。

10. 货物和运输安全控制：

11. 制定详细的安全措施，确保货物在存放、搬运及运输过程中的安全性和完整性。

12. 自动化系统必须使用需要定期更换口令的个人担保账户，并实施信息技术安全标准、程序和政策。

13. 访客控制和背景调查：

14. 制定严格的访客管理制度，对访客进行身份验证和登记。

15. 对新员工进行身份背景核实，并定期对现有员工进行背景调查，确保没有参与任何违法犯罪活动。

16. 内部审核和模拟外部审核：

17. 在提交C-TPAT认证申请前，企业需要进行内部审核，确保所有改进措施得到有效执行，并符合C-TPAT的要求。

18. 可以考虑进行模拟外部审核，以检验内部审核的有效性和准备工作的充分性。

这些机构可能只是众多可开展C-TPAT认证的机构中的一部分。企业在寻求C-TPAT认证时，应直接访问美国海关和边境保护局（CBP）的guanfangwangzhan或联系相关机构，以获取新和准确的信息。