产品或流程不可用：在审核期间，如果审核范围内的产品或流程不在生产或加工中，这些项目将不被包括在证书范围内，可能导致审核延误。

关键或主要不符合项：如果在审核中识别出关键或主要不符合项，并且这些不符合项是由系统控制的重大故障引起的，认证决定将被推迟，直到采取了纠正措施。

次要不符合项：次要不符合项不会阻止注册推荐，但可能会延迟认证，因为需要提交计划的行动，并由在认证决定之前进行审查。

审计证据抽样：所有评估结论都是基于审计证据的抽样，以证明管理体系的有效实施、对流程的控制以及朝着实现声明的食品安全目标所取得的进展。如果抽样不充分或存在问题，可能会导致审核延误。

审计报告和批准：在第二阶段审核结束时，审计员会在现场提出建议并讨论发现的问题。报告随后在场外编制，并由授权的报告签署人审查和批准。证书的决定一旦做出，证书就会处理并发送给客户，这个过程可能会因为报告的编制和批准而延迟。

合同过程：包括申请、范围确定、审计时间包括审计持续时间以及合同的签订。

规划和管理审计：涉及一般指导、多个功能跨多个场所的管理、多场所认证、不通知审计、信息和通信技术的使用、认证转移、升级审计、过渡审计、审计团队的分配以及严重事件的管理。

审计文件：包括书面审计报告、不符合项以及其他审计文件。

认证决定过程：涉及一般指导、证书设计和内容、证书暂停或撤回或范围减少。

持续维护：监督访问：证书发行后，需要定期的监督访问以确保体系的持续合规。

食品安全管理体系要求：包括ISO 22000:2018食品安全管理体系要求、特定行业的前提方案（PRPs）要求（ISO/TS 22002-x系列或其他指定的PRP标准）以及FSSC 22000额外要求。

审计团队和审计师轮换：审计团队不允许在同一认证场所执行超过两个3年认证周期（六年）的审计。

这些步骤和因素构成了FSSC22000认证审核的基本程序和可能的延误因素。