工厂配合IATF16949认证，需要遵循以下步骤和要求：

1. 系统准备：企业决定进行IATF16949体系认证，并成立一个指定团队来负责推动整个认证过程。该团队应该包括管理人员和质量经理等关键人员。

2. 认证准备：企业根据IATF16949标准要求，对现有的质量管理体系进行评估，并发现与标准要求不符的地方。然后，企业应该根据评估结果制定相应的行动计划，对体系进行改进。

3. 文件和记录：确保所有必要的程序文件、工作指导书和记录都是新的，并且符合IATF16949的要求。这包括但不限于质量手册、程序文件、作业指导书和各种记录。

4. 培训：对员工进行IATF16949标准的培训，确保他们理解要求，并能够在日常工作中实施这些要求。

5. 内部审核和管理评审：进行内部审核以检查体系的符合性和有效性，并进行管理评审以确保体系持续改进。

6. 差距分析：将已确定的需求与质量管理体系的范围相匹配，通过设计和调整相关程序和流程来弥补任何差距。

7. 实施和文档化：在确定的范围内实施新的流程和程序，并为在系统内工作的员工提供培训，以确保达到所要求的结果。运行质量管理体系至少12个月，才能跟踪其有效性，改进过程并记录结果。如果内部审核或管理评审发现任何问题，必须找出根本原因并采取措施予以纠正。

8. 审核策划：组织必须在下个审核日期开始前至少90天确定审核时间，以确保认证机构资源的有效调配，不包括特殊审核；组织必须在审核开始日前至少30天提供审核策划所需要的信息，以便认证机构的审核组策划审核。

9. 不符合项管理：针对严重不符合项，组织必须在15天内回复严重不符合项，包括纠正措施和措施有效性的证据；自审核末次会议结束之日起，应在30天内向认证机构答复纠正措施的实施情况。

关于IATF16949认证审核需要多长时间，认证过程通常包括两个阶段的审核：

1. 阶段审核（文件审核）：评估组织的需求和/或文件，以确保与IATF16949相关的所有过程的系统控制。

2. 第二阶段审核（现场审核）：以面谈和在客户现场考察的形式，验证IATF16949的要求是否得到有效实施。这包括基于组织保存的记录的检查过程，如可用的测量结果、会议记录、培训和资格记录、投诉管理和记录，以及组织发起的改进项目。

从申请认证到拿到证书，通常需要1-3个月的时间，具体时间取决于企业的执行与推行的配合度，以及在推行过程中组织机构是否发生变化，要求是否发生变化等因素。此外，认证机构在审核过程中可能会发现不符合项，企业需要在规定时间内完成整改并由认证机构验证，这也会影响整体的认证时间。